Sinaptogirin-1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SYNGR1 sa hromosoma 22.[5][6][7]

SYNGR1
Identifikatori
AliasiSYNGR1
Vanjski ID-jeviOMIM: 603925 MGI: 1328323 HomoloGene: 3456 GeneCards: SYNGR1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 22 (čovjek)
Hrom.Hromosom 22 (čovjek)[1]
Hromosom 22 (čovjek)
Genomska lokacija za SYNGR1
Genomska lokacija za SYNGR1
Bend22q13.1Početak39,349,925 bp[1]
Kraj39,385,575 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 15 (miš)
Hrom.Hromosom 15 (miš)[2]
Hromosom 15 (miš)
Genomska lokacija za SYNGR1
Genomska lokacija za SYNGR1
Bend15|15 E1Početak79,975,535 bp[2]
Kraj80,003,702 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta Melanosom
integral component of membrane
međućelijske veze
Nervno-mišićna veza
sinapsa
synaptic vesicle membrane
membrana
Sinapsna vezikula
ćelijska membrana
azurophil granule membrane
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
integral component of synaptic vesicle membrane
Biološki proces regulation of short-term neuronal synaptic plasticity
Ciljanje proteina
regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
neutrophil degranulation
cellular response to leukemia inhibitory factor
regulated exocytosis
synaptic vesicle membrane organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_145738
NM_004711
NM_145731

NM_009303
NM_207708

RefSeq (bjelančevina)

NP_004702
NP_663783
NP_663791

NP_033329
NP_997591

Lokacija (UCSC)Chr 22: 39.35 – 39.39 MbChr 15: 79.98 – 80 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 233 aminokiseline, a molekulska težina 25.456 Da.[7]

1020304050
MEGGAYGAGKAGGAFDPYTLVRQPHTILRVVSWLFSIVVFGSIVNEGYLN
SASEGEEFCIYNRNPNACSYGVAVGVLAFLTCLLYLALDVYFPQISSVKD
RKKAVLSDIGVSAFWAFLWFVGFCYLANQWQVSKPKDNPLNEGTDAARAA
IAFSFFSIFTWAGQAVLAFQRYQIGADSALFSQDYMDPSQDSSMPYAPYV
EPTGPDPAGMGGTYQQPANTFDTEPQGYQSQGY

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira integralni membranski protein povezan sa presinapsnim vezikula mau neuronskim ćelijama. Tačna funkcija ovog proteina je nejasna, ali studije sličnog mišjeg proteina sugeriraju da funkcionira u sinapsnoj plastičnosti, a da nije potreban za sinapsni prijenos. Genski proizvod pripada porodici gena sinaptogirina. Identificirane su tri alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju tri različite izoforme.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100321 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022415 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kedra D, Pan HQ, Seroussi E, Fransson I, Guilbaud C, Collins JE, Dunham I, Blennow E, Roe BA, Piehl F, Dumanski JP (Oct 1998). "Characterization of the human synaptogyrin gene family". Hum Genet. 103 (2): 131–41. doi:10.1007/s004390050795. PMID 9760194. S2CID 2310048.
  6. ^ Janz R, Sudhof TC, Hammer RE, Unni V, Siegelbaum SA, Bolshakov VY (Jan 2000). "Essential roles in synaptic plasticity for synaptogyrin I and synaptophysin I". Neuron. 24 (3): 687–700. doi:10.1016/S0896-6273(00)81122-8. PMID 10595519.
  7. ^ a b c "Entrez Gene: SYNGR1 synaptogyrin 1".

Dopunska literatura

uredi