Stromski membranski pridruženi protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SMAP1.[5][6][7]

SMAP1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2CRR

Identifikatori
AliasiSMAP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 611372 MGI: 2138261 HomoloGene: 134676 GeneCards: SMAP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za SMAP1
Genomska lokacija za SMAP1
Bend6q13Početak70,667,776 bp[1]
Kraj70,862,011 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za SMAP1
Genomska lokacija za SMAP1
Bend1|1 A5Početak23,883,927 bp[2]
Kraj23,961,398 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija clathrin binding
vezivanje iona metala
GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Ćelijska komponenta citoplazma
ćelijska membrana
membrana
Biološki proces GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
regulation of clathrin-dependent endocytosis
positive regulation of erythrocyte differentiation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001044305
NM_001281439
NM_001281440
NM_021940

NM_001290683
NM_028534
NM_001357395

RefSeq (bjelančevina)

NP_001037770
NP_001268368
NP_001268369
NP_068759

NP_001277612
NP_082810
NP_001344324

Lokacija (UCSC)Chr 6: 70.67 – 70.86 MbChr 1: 23.88 – 23.96 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein kodiran ovim genom sličan je mišjem proteinu 1 povezanom sa stromskom membranom. Ova sličnost sugerira da je ovaj ljudski genski proizvod također tip II membranski glikoprotein uključen u eritropoetsku stimulacijsku aktivnost stromnih ćelija. Alternativna prerada rezultira u više varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 467 aminokiselina, а molekulska težina 50.386 Da.[8]

1020304050
MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREEDNKYCADCEAKGPRWASWNIGV
FICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEA
NLPENFRRPQTDQAVEFFIRDKYEKKKYYDKNAIAITNISSSDAPLQPLV
SSPSLQAAVDKNKLEKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTAEKLQKKDQQL
EPKKSTSPKKAAEPTVDLLGLDGPAVAPVTNGNTTVPPLNDDLDIFGPMI
SNPLPATVMPPAQGTPSAPAAATLSTVTSGDLDLFTEQTTKSEEVAKKQL
SKDSILSLYGTGTIQQQSTPGVFMGPTNIPFTSQAPAAFQGFPSMGVPVP
AAPGLIGNVMGQSPSMMVGMPMPNGFMGNAQTGVMPLPQNVVGPQGGMVG
QMGAPQSKFGLPQAQQPQWSLSQMNQQMAGMSISSATPTAGFGQPSSTTA
GWSGSSSGQTLSTQLWK

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000112305 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026155 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Sato Y, Hong HN, Yanai N, Obinata M (Sep 1998). "Involvement of stromal membrane-associated protein (SMAP-1) in erythropoietic microenvironment". J Biochem. 124 (1): 209–16. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022082. PMID 9644265.
  6. ^ Marcos I, Borrego S, Rodriguez de Cordoba S, Galan JJ, Antinolo G (Jul 2002). "Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SMAP1 gene". Gene. 292 (1–2): 167–71. doi:10.1016/S0378-1119(02)00645-5. PMID 12119110.
  7. ^ a b "SMAP1 small ArfGAP 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 7. 5. 2021.
  8. ^ "UniProt, Q8IYB5". Pristupljeno 27. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi