Idi na sadržaj

DDX47

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
DDX47
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3BER

Identifikatori
AliasiDDX47
Vanjski ID-jeviOMIM: 615428 MGI: 1915005 HomoloGene: 6092 GeneCards: DDX47
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za DDX47
Genomska lokacija za DDX47
Bend12p13.1Početak12,813,316 bp[1]
Kraj12,829,981 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za DDX47
Genomska lokacija za DDX47
Bend6|6 G1Početak134,988,575 bp[2]
Kraj135,000,739 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
hydrolase activity
ATP binding
GO:0008026 helicase activity
nucleic acid binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta Jedarce
membrana
jedro
nukleoplazma
citoplazma
Biološki proces mRNA processing
extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
RNA secondary structure unwinding
Prerada RNK
GO:0097285 apoptoza
rRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_201224
NM_016355

NM_026360

RefSeq (bjelančevina)

NP_057439
NP_957518

NP_080636

Lokacija (UCSC)Chr 12: 12.81 – 12.83 MbChr 6: 134.99 – 135 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Vjerovatno ATP-ovisna RNK-helikaza DDX47 jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom DDX47.[5]

Ovaj gen kodira člana proteinske porodice DEAD-boks. Proteini iz kutije DEAD, okarakterizirani konzerviranim motivom Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), pretpostavljene su RNK-helikaze. Uključeni su u brojne ćelijske procese, koji uključuju promjenu sekundarne strukture RNK, kao što je iniciranje translacije, jedarne i mitohondrijske prerade i sklapanja ribosoma i splajsosoma. Na osnovu njihovih obrazaca distribucije, vjeruje se da su neki članovi ove porodice uključeni u embriogenezu, spermatogenezu i ćelijski rast i diobu. Protein kodiran ovim genom može se kretati između jedra i citoplazme, te ima aktivnost ATPaza neovisnih o RNK. Za ovaj gen su pronađene dvije alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[5]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 455 aminokiselina, a molekulska težina 50.647 Da.[6]

1020304050
MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKI
QIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTP
TRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATP
GRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRK
TFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFK
DTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHR
VGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLT
ERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMK
KRKGR
Simboli

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213782 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030204 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: DDX47 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 47".
  6. ^ "UniProt, Q9H0S4". Pristupljeno 8. 8. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]