Idi na sadržaj

FGFR4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
FGFR4
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4QQ5, 4QQC, 4QQJ, 4QQT, 4QRC, 4R6V, 4TYE, 4TYG, 4TYI, 4TYJ, 4UXQ, 4XCU

Identifikatori
AliasiFGFR4
Vanjski ID-jeviOMIM: 134935 MGI: 95525 HomoloGene: 20461 GeneCards: FGFR4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za FGFR4
Genomska lokacija za FGFR4
Bend5q35.2Početak177,086,905 bp[1]
Kraj177,098,144 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za FGFR4
Genomska lokacija za FGFR4
Bend13 B1|13 29.8 cMPočetak55,300,453 bp[2]
Kraj55,316,572 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
nucleotide binding
protein kinase activity
heparin binding
kinase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
protein tyrosine kinase activity
fibroblast growth factor binding
fibroblast growth factor-activated receptor activity
ATP binding
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity
1-phosphatidylinositol-3-kinase activity
Receptorska tirozin-kinaza
transmembrane signaling receptor activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endozom
Golđijev aparat
membrana
cell-cell junction
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
transport vesicle
extracellular region
Endoplazmatski retikulum
citoplazma
receptor complex
Biološki proces glucose homeostasis
Fosforilacija
phosphate ion homeostasis
response to bile acid
regulation of extracellular matrix disassembly
MAPK cascade
regulation of bile acid biosynthetic process
fibroblast growth factor receptor signaling pathway
regulation of lipid metabolic process
protein phosphorylation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of DNA biosynthetic process
positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
positive regulation of proteolysis
protein autophosphorylation
peptidyl-tyrosine phosphorylation
Ćelijska migracija
phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process
GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process
positive regulation of protein kinase B signaling
cholesterol homeostasis
Angiogeneza
negative regulation of signal transduction
Ćelijska diferencijacija
negative regulation of apoptotic process
transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
nervous system development
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001291980
NM_002011
NM_022963
NM_213647
NM_001354984

NM_008011

RefSeq (bjelančevina)

NP_001278909
NP_002002
NP_075252
NP_998812
NP_001341913

NP_032037

Lokacija (UCSC)Chr 5: 177.09 – 177.1 MbChr 13: 55.3 – 55.32 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Receptor 4 faktora rasta fibroblasta jest protein/enzim koji je kod ljudi kodiran genom FGFR4 sa hromosoma 5. Označava se i kao CD334 (klaster diferencjjacije 334).

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 802 aminokiseline, а molekulska težina 87.954 Da.[5]

1020304050
MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQELTVALG
QPVRLCCGRAERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYL
CLARGSMIVLQNLTLITGDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWT
HPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGI
RLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLDVLERSPHRPI
LQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGSSFGADGFP
YVQVLKTADINSSEVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTV
LPEEDPTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP
RPPATVQKLSRFPLARQFSLESGSSGKSSSSLVRGVRLSSSGPALLAGLV
SLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTV
AVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIV
ECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVARGM
QYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGR
LPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFS
LLREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAV
SEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTCSSSDSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGV
QT

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom član je porodice receptora faktora rasta fibroblasta, gdje je aminokiselinska sekvenca visoko konzervirana između članova i tokom evolucije. Članovi porodice FGFR međusobno se razlikuju po svojim ligandnim afinitetima i tkivnoj raspodjeli. Reprezentativni protein pune dužine sastojao bi se od vanćelijske regije, sastavljene od tri imunoglobulinu slična domena, jednog hidrofobnog segmenta koji pokriva membranu i citoplazmatskog domena tirozin-kinaze. Vanćelijski dio proteina stupa u interakciju s faktorima rasta fibroblasta, pokrećući kaskadu nizvodnih signala, što na kraju utiče na mitogenezu i diferencijaciju.

Genomska organizacija ovog gena, u poređenju sa članovima 1-3, obuhvaTa 18 egzona umjesto 19 ili 20. Iako je primijećena alternativna prerada, nema dokaza da je C-terminalna polovina domena IgIII ovog proteina varira između tri alternativna oblika, kako je naznačeno za članove 1-3. Ovaj član porodice prvenstveno veže kiseli faktor rasta fibroblasta i, iako je njegova specifična funkcija nepoznata, prekomjerno je izražen u uzorcima tumora ženskih reproduktivnih organa, što ukazuje na ulogu u tumorigenezi dojke i jajnika.[6] U meta-analizi, uočeno je da je funkcionalni polimorfizam Gly388Arg (rs351855) FGFR4 značajno povezan sa zahvatanjem čvorova i ukupnim preživljavanjem kod pacijenata sa različitim tipovima raka.[7]

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da receptor 4 faktora rasta fibroblasta stupa u interakcije sa FGF1.[8][9]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160867 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005320 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "UniProt, P22455" (jezik: англ.). Pristupljeno 15. 10. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
  6. ^ "Entrez Gene: FGFR4 fibroblast growth factor receptor 4".
  7. ^ Frullanti, E (2011). "Meta and pooled analyses of FGFR4 Gly388Arg polymorphism as a cancer prognostic factor". Eur J Cancer Prev. 20 (4): 340–347. doi:10.1097/CEJ.0b013e3283457274. PMID 21412156. S2CID 29668012.
  8. ^ Loo, B B; Darwish K K; Vainikka S S; Saarikettu J J; Vihko P P; Hermonen J J; Goldman A A; Alitalo K K; Jalkanen M M (maj 2000). "Production and characterization of the extracellular domain of recombinant human fibroblast growth factor receptor 4". Int. J. Biochem. Cell Biol. ENGLAND. 32 (5): 489–97. doi:10.1016/S1357-2725(99)00145-4. ISSN 1357-2725. PMID 10736564.
  9. ^ Kan, M; Wu X; Wang F; McKeehan W L (maj 1999). "Specificity for fibroblast growth factors determined by heparan sulfate in a binary complex with the receptor kinase". J. Biol. Chem. UNITED STATES. 274 (22): 15947–52. doi:10.1074/jbc.274.22.15947. ISSN 0021-9258. PMID 10336501.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.

Šablon:PortalBiologija