Idi na sadržaj

GCNT1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
GCNT1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2GAK, 2GAM, 3OTK

Identifikatori
AliasiGCNT1
Vanjski ID-jeviOMIM: 600391 MGI: 95676 HomoloGene: 37486 GeneCards: GCNT1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za GCNT1
Genomska lokacija za GCNT1
Bend9q21.13Početak76,419,850 bp[1]
Kraj76,651,203 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 19 (miš)
Hrom.Hromosom 19 (miš)[2]
Hromosom 19 (miš)
Genomska lokacija za GCNT1
Genomska lokacija za GCNT1
Bend19 B|19 12.75 cMPočetak17,303,505 bp[2]
Kraj17,350,208 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
acetylglucosaminyltransferase activity
glycosyltransferase activity
beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
Golđijev aparat
membrana
Golgi cisterna
trans-Golđijeva mreža
Golđijeva membrana
Vanćelijsko
Biološki proces glycoprotein biosynthetic process
tissue morphogenesis
response to insulin
GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation
kidney morphogenesis
O-glycan processing
leukocyte tethering or rolling
cell adhesion molecule production
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001097633
NM_001097634
NM_001097635
NM_001097636
NM_001490

NM_001136484
NM_010265
NM_173442

RefSeq (bjelančevina)

NP_001091102
NP_001091103
NP_001091104
NP_001091105
NP_001481

NP_001129956
NP_034395
NP_775618

Lokacija (UCSC)Chr 9: 76.42 – 76.65 MbChr 19: 17.3 – 17.35 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Beta-1,3-galactozil-O-glikozil-glokoprotein beta-1,6-N-acetilglukozaminoltransferaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom GCNT1.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 428 aminokiselina, а molekulska težina 49.799 Da.[8]

1020304050
MLRTLLRRRLFSYPTKYYFMVLVLSLITFSVLRIHQKPEFVSVRHLELAG
ENPSSDINCTKVLQGDVNEIQKVKLEILTVKFKKRPRWTPDDYINMTSDC
SSFIKRRKYIVEPLSKEEAEFPIAYSIVVHHKIEMLDRLLRAIYMPQNFY
CIHVDTKSEDSYLAAVMGIASCFSNVFVASRLESVVYASWSRVQADLNCM
KDLYAMSANWKYLINLCGMDFPIKTNLEIVRKLKLLMGENNLETERMPSH
KEERWKKRYEVVNGKLTNTGTVKMLPPLETPLFSGSAYFVVSREYVGYVL
QNEKIQKLMEWAQDTYSPDEYLWATIQRIPEVPGSLPASHKYDLSDMQAV
ARFVKWQYFEGDVSKGAPYPPCDGVHVRSVCIFGAGDLNWMLRKHHLFAN
KFDVDVDLFAIQCLDEHLRHKALETLKH

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen je član beta-1,3-N-acetilglukozaminiltransferaza 3. Od suštinskog je značaja za stvaranje Gal beta 1-3 (GlcNAc beta 1-6) GalNAc struktura i jezgra 2 O-glikanske grane. Gen koji kodira ovaj enzim prvobitno je mapiran na 9q21, ali je kasnije lokaliziran na 9q13. Identificirano je više alternativno prerađenih varijanti, koje kodiraju isti protein.[7]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187210 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038843 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Bierhuizen MF, Mattei MG, Fukuda M (Apr 1993). "Expression of the developmental I antigen by a cloned human cDNA encoding a member of a beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase gene family". Genes Dev. 7 (3): 468–78. doi:10.1101/gad.7.3.468. PMID 8449405.
  6. ^ Yeh JC, Ong E, Fukuda M (Mar 1999). "Molecular cloning and expression of a novel beta-1, 6-N-acetylglucosaminyltransferase that forms core 2, core 4, and I branches". J Biol Chem. 274 (5): 3215–21. doi:10.1074/jbc.274.5.3215. PMID 9915862.
  7. ^ a b "Entrez Gene: GCNT1 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase)".
  8. ^ "UniProt, Q02742". Pristupljeno 9. 9. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]