Idi na sadržaj

MUPCDH

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
MUPCDH
Identifikatori
AliasiCDHR5
Vanjski ID-jeviOMIM: 606839 MGI: 1919290 HomoloGene: 69345 GeneCards: CDHR5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za MUPCDH
Genomska lokacija za MUPCDH
Bend11p15.5Početak616,577 bp[1]
Kraj626,078 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za MUPCDH
Genomska lokacija za MUPCDH
Bend7|7 F5Početak140,848,996 bp[2]
Kraj140,856,699 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija calcium ion binding
beta-catenin binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
cell adhesion molecule binding
Ćelijska komponenta integral component of membrane
spanning component of plasma membrane
brush border membrane
clathrin-coated pit
ćelijska membrana
Egzosom
membrana
projekcija ćelije
microvillus membrane
apical plasma membrane
Biološki proces Ćelijska adhezija
regulation of microvillus length
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
intermicrovillar adhesion
Ćelijska diferencijacija
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001171968
NM_017717
NM_021924
NM_031264
NM_031265

NM_001114322
NM_028069

RefSeq (bjelančevina)

NP_001165439
NP_068743
NP_112554

NP_001107794
NP_082345

Lokacija (UCSC)Chr 11: 0.62 – 0.63 MbChr 7: 140.85 – 140.86 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Mucinski i kadherinoliki protein je protein koji je kod ljudi kodiran genom MUPCDH.[5][6][7]

Ovaj gen je novi gen sličan mucinu koji je član potporodice kadherina. Dok kodiranje mucinskih nepolimorfnih tandemskih ponavljanja bogatih prolinom, serinom i s treoninom sličnih proteina, gen također sadrži sekvencu kojs kodira motive vezanja kalcija koji se nalaze u svim kadherinima. Uloga hibridne vanćelijske regije i specifična funkcija ovog proteina još nisu utvrđene. Identificiran je alternativna prerada, pri čemu je uočena varijacija rezultirala prisutnošću ili odsutnošću domena. Osim toga, dolazi do spajanja u 5' UTR-a, ali transkripti, uključujući i ove varijante nisu u potpunosti opisani.[7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 845 aminokiselina, a molekulska težina 88.223 Da.[8]

1020304050
MGSWALLWPPLLFTGLLVRPPGTMAQAQYCSVNKDIFEVEENTNVTEPLV
DIHVPEGQEVTLGALSTPFAFRIQGNQLFLNVTPDYEEKSLLEAQLLCQS
GGTLVTQLRVFVSVLDVNDNAPEFPFKTKEIRVEEDTKVNSTVIPETQLQ
AEDRDKDDILFYTLQEMTAGASDYFSLVSVNRPALRLDRPLDFYERPNMT
FWLLVRDTPGENVEPSHTATATLVLNVVPADLRPPWFLPCTFSDGYVCIQ
AQYHGAVPTGHILPSPLVLRPGPIYAEDGDRGINQPIIYSIFRGNVNGTF
IIHPDSGNLTVARSVPSPMTFLLLVKGQQADLARYSVTQVTVEAVAAAGS
PPRFPQRLYRGTVARGAGAGVVVKDAAAPSQPLRIQAQDPEFSDLNSAIT
YRITNHSHFRMEGEVVLTTTTLAQAGAFYAEVEAHNTVTSGTATTVIEIQ
VSEQEPPSTDVPPSPEAGGTTGPWTSTTSEVPRPPEPSQGPSTTSSGGGT
GPHPPSGTTLRPPTSSTPGGPPGAENSTSHQPATPGGDTAQTPKPGTSQP
MPPGVGTSTSHQPATPSGGTAQTPEPGTSQPMPPSMGTSTSHQPATPGGG
TAQTPEAGTSQPMPPGMGTSTSHQPTTPGGGTAQTPEPGTSQPMPLSKST
PSSGGGPSEDKRFSVVDMAALGGVLGALLLLALLGLAVLVHKHYGPRLKC
CCGKAPEPQPQGFDNQAFLPDHKANWAPVPSPTHDPKPAEAPMPAEPAPP
GPASPGGAPEPPAAARAGGSPTAVRSILTKERRPEGGYKAVWFGEDIGTE
ADVVVLNAPTLDVDGASDSGSGDEGEGAGRGGGPYDAPGGDDSYI

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c ENSG00000273572 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000099834, ENSG00000273572 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025497 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Paris MJ, Williams BR (Jan 2001). "Characterization of a 500-kb contig spanning the region between c-Ha-Ras and MUC2 on chromosome 11p15.5". Genomics. 69 (2): 196–202. doi:10.1006/geno.2000.6339. PMID 11031102.
  6. ^ Goldberg M, Peshkovsky C, Shifteh A, Al-Awqati Q (Sep 2000). "mu-Protocadherin, a novel developmentally regulated protocadherin with mucin-like domains". J Biol Chem. 275 (32): 24622–9. doi:10.1074/jbc.M000234200. PMID 10801787. S2CID 42493271.
  7. ^ a b "Entrez Gene: MUCDHL mucin and cadherin-like".
  8. ^ "UniProt, Q9HBB8". Pristupljeno 19. 8. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]