Idi na sadržaj

PDXK

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
PDXK
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2AJP, 2F7K, 2YXT, 2YXU, 3FHX, 3FHY, 3KEU, 4EN4, 4EOH

Identifikatori
AliasiPDXK
Vanjski ID-jeviOMIM: 179020 MGI: 1351869 HomoloGene: 2731 GeneCards: PDXK
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 21 (čovjek)
Hrom.Hromosom 21 (čovjek)[1]
Hromosom 21 (čovjek)
Genomska lokacija za PDXK
Genomska lokacija za PDXK
Bend21q22.3Početak43,719,094 bp[1]
Kraj43,762,307 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za PDXK
Genomska lokacija za PDXK
Bend10 C1|10 39.72 cMPočetak78,272,578 bp[2]
Kraj78,300,809 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
nucleotide binding
protein homodimerization activity
pyridoxal kinase activity
vezivanje iona cinka
potassium ion binding
sodium ion binding
vezivanje iona metala
kinase activity
lithium ion binding
pyridoxal phosphate binding
ATP binding
magnesium ion binding
Ćelijska komponenta citosol
Egzosom
jedro
extracellular region
citoplazma
secretory granule lumen
specific granule lumen
nukleoplazma
Biološki proces pyridoxal phosphate biosynthetic process
Fosforilacija
pyridoxal 5'-phosphate salvage
Ćelijska proliferacija
neutrophil degranulation
vitamin B6 metabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003681
NM_021941
NM_001331030

NM_172134

RefSeq (bjelančevina)

NP_001317959
NP_003672

NP_742146

Lokacija (UCSC)Chr 21: 43.72 – 43.76 MbChr 10: 78.27 – 78.3 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Piridoksal-kinaza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom PDXK sa hromosoma 21.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 312 aminokiselina, a molekulska težina 35.102 Da.[6]

1020304050
MEEECRVLSIQSHVIRGYVGNRAATFPLQVLGFEIDAVNSVQFSNHTGYA
HWKGQVLNSDELQELYEGLRLNNMNKYDYVLTGYTRDKSFLAMVVDIVQE
LKQQNPRLVYVCDPVLGDKWDGEGSMYVPEDLLPVYKEKVVPLADIITPN
QFEAELLSGRKIHSQEEALRVMDMLHSMGPDTVVITSSDLPSPQGSNYLI
VLGSQRRRNPAGSVVMERIRMDIRKVDAVFVGTGDLFAAMLLAWTHKHPN
NLKVACEKTVSTLHHVLQRTIQCAKAQAGEGVRPSPMQLELRMVQSKRDI
EDPEIVVQATVL

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom fosforilira vitamin B6, korak potreban za konverziju vitamina B6 u piridoksal-5-fosfat, važan kofaktor u posrednom metabolizmu. Kodirani protein je citoplazmatski] i vjerovatno djeluje kao homodimer. Opisane su alternativno prerađene varijante transkripta, ali njihova biološka valjanost nije utvrđena.[6]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160209 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032788 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hanna MC, Turner AJ, Kirkness EF (May 1997). "Human pyridoxal kinase. cDNA cloning, expression, and modulation by ligands of the benzodiazepine receptor". J Biol Chem. 272 (16): 10756–60. doi:10.1074/jbc.272.16.10756. PMID 9099727.
  6. ^ a b c "Entrez Gene: PDXK pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) kinase".

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]