Idi na sadržaj

PTOV1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
PTOV1
Identifikatori
AliasiPTOV1
Vanjski ID-jeviOMIM: 610195 MGI: 1933946 HomoloGene: 9687 GeneCards: PTOV1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za PTOV1
Genomska lokacija za PTOV1
Bend19q13.33Početak49,850,735 bp[1]
Kraj49,860,744 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za PTOV1
Genomska lokacija za PTOV1
Bend7 B3|7Početak44,512,491 bp[2]
Kraj44,519,212 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001305105
NM_001305108
NM_017432
NM_001364745
NM_001364747

NM_001364748
NM_001364749
NM_001364750
NM_001394010

NM_133949

RefSeq (bjelančevina)
NP_001292034
NP_001292037
NP_059128
NP_001351674
NP_001351676

NP_001351677
NP_001351678
NP_001351679

NP_598710

Lokacija (UCSC)Chr 19: 49.85 – 49.86 MbChr 7: 44.51 – 44.52 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Prekomjerno eksprimirani protein 1 tumora prostateje protein koji je kod ljudi kodiran genom PTOV1.[5][6][7]

Benedit et al. (2001.) utvrdili su da gen PTOV1 sadrži 12 egzona.[8]

Kloniranje i ekspresija

[uredi | uredi izvor]

Koristeći diferencijalni prikaz za identifikaciju gena povećanih u tumorima prostate, praćene analizom baze podataka i RT-PCR, Benedit et al. (2001) klonirali su PTOV1. Izvedeni protein od 416 aminokiselina sastoji se gotovo u potpunosti od dva tandemski poredana bloka koja dijele 66% identiteta i pridruženi su kratkom veznom sekvencom. Predviđalo se da PTOV1 formira naizmjenične alfa-helikse i beta-listove. Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,8 kb obilno izražen u mozgu, srcu, skeletnim mišićima, bubrezima i jetri. Normalna prostata eksprimira nizak nivo PTOV1. Western blot analizom tkiva tumora prostate otkriven je PTOV1 pri prividnoj molekulskoj masi od 58 kD. Imunocitohemijska analiza otkrila je endogeni PTOV1 u citoplazmi, koncentriran oko jedra.

Funkcija gena

[uredi | uredi izvor]

Benedit et al. (2001.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u devet ili 11 uzoraka tumora prostate. Bio je izrazito prekomjerno izražen u žarištima tumora prostate sa malignom morfologijom i bio je povišen umjeren, ali s homogenom raspodjelom, u morfološki normalnim ćelijama smještenim u benignim perifernim zonama istih tumora. U ćelijskoj liniji karcinoma prostate kod ljudi, ekspresija PTOV1 povećala se nakon izlaganja 5-alfa-dihidroksistestosteronu.

Imunohistokemijskom analizom, Santamaria et al. (2003.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u 71% od 38 karcinoma prostate i u 80% uzoraka s intraepitelnom neoplazijom prostate. Visoki nivoi PTOV1 u tumorima značajno koreliraju sa proliferativnim indeksom i lokalizacijom PTOV1 u jedru. U mirno kultiviranim stanicama tumora prostate, PTOV1 se lokalizirao u citoplazmi i izuzeo se iz jedara. Nakon serumske stimulacije, PTOV1 se djelimično translocirao u jedto, na početku S faze. Na kraju mitoze, PTOV1 je izašao iz jedra. Privremena transfekcija PTOV1 fluorescentno označenog prisilnog ulaska ćelija u S-fazi i povećana ekspresija ciklina D1 (CCND1).

Santamaria i et al. (2005.) otkrili su da je PTOV1 stupio u interakciju s lipidnim prenosnim proteinom flotilinom-1 (FLOT1) u frakcijama nerastvorljivih u deterdžentu. Flotillin-1 se kolokalizirao s PTOV1 na plazmamembrani i u jedru, a ušao je u njega istovremeno s PTOV1, malo prije pokretanja S faze. Tokom ćelijskog ciklusa, razine proteina PTOV1 i flotilin-1 su oscilirale, sa vrhuncem u S-fazi. Iscrpljivanje PTOV1 značajno je inhibiralo jedarnu lokalizaciju flotilina-1, dok iscrpljivanje flotillina-1 nije na to uticalo. Iscrpljivanje bilo kojeg proteina izrazito je inhibiralo proliferaciju ćelija u baznim uvjetima. Prekomjerna ekspresija PTOV1 ili flotilin-1 snažno je inducirala proliferaciju, koja je zahtijevala njihovu lokalizaciju u jedru i ovisila je o recipročnom proteinu. Santamaria i et al. (2005.) zaključili su da PTOV1 pomaže flotilinu-1 u njegovoj translokaciji u jedru i da su oba proteina potrebna za proliferaciju ćelija.[9][10]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]
Simboli
1020304050
MVRPRRAPYRSGAGGPLGGRGRPPRPLVVRAVRSRSWPASPRGPQPPRIR
ARSAPPMEGARVFGALGPIGPSSPGLTLGGLAVSEHRLSNKLLAWSGVLE
WQEKRRPYSDSTAKLKRTLPCQAYVNQGENLETDQWPQKLIMQLIPQQLL
TTLGPLFRNSQLAQFHFTNRDCDSLKGLCRIMGNGFAGCMLFPHISPCEV
RVLMLLYSSKKKIFMGLIPYDQSGFVSAIRQVITTRKQAVGPGGVNSGPV
QIVNNKFLAWSGVMEWQEPRPEPNSRSKRWLPSHVYVNQGEILRTEQWPR
KLYMQLIPQQLLTTLVPLFRNSRLVQFHFTKDLETLKSLCRIMDNGFAGC
VHFSYKASCEIRVLMLLYSSEKKIFIGLIPHDQGNFVNGIRRVIANQQQV
LQRNLEQEQQQRGMGG

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104960 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038502 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Santamaria A, Fernandez PL, Farre X, Benedit P, Reventos J, Morote J, Paciucci R, Thomson TM (Feb 2003). "PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle". Am J Pathol. 162 (3): 897–905. doi:10.1016/S0002-9440(10)63885-0. PMC 1868092. PMID 12598323.
  6. ^ Santamaria A, Castellanos E, Gomez V, Benedit P, Renau-Piqueras J, Morote J, Reventos J, Thomson TM, Paciucci R (Feb 2005). "PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts". Mol Cell Biol. 25 (5): 1900–11. doi:10.1128/MCB.25.5.1900-1911.2005. PMC 549350. PMID 15713644.
  7. ^ "Entrez Gene: PTOV1 prostate tumor overexpressed gene 1".
  8. ^ Benedit, P., Paciucci, R., Thomson, T. M., Valeri, M., Nadal, M., Caceres, C., de Torres, I., Estivill, X., Lozano, J. J., Morote, J., Reventos, J. PTOV1, a novel protein overexpressed in prostate cancer containing a new class of protein homology blocks. Oncogene 20: 1455-1464, 2001. [PubMed]: 11313889
  9. ^ Santamaria, A., Castellanos, E., Gomez, V., Benedit, P., Renau-Piqueras, J., Morote, J., Reventos, J., Thomson, T. M., Paciucci, R. PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts. Molec. Cell. Biol. 25: 1900-1911, 2005. [PubMed]: 15713644
  10. ^ Santamaria, A., Fernandez, P. L., Farre, X., Benedit, P., Reventos, J., Morote, J., Paciucci, R., Thomson, T. M. PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle. Am. J. Path. 162: 897-905, 2003. [PubMed]: 12598323

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]