Idi na sadržaj

SSR1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SSR1
Identifikatori
AliasiSSR1
Vanjski ID-jeviOMIM: 600868 MGI: 105082 HomoloGene: 2368 GeneCards: SSR1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za SSR1
Genomska lokacija za SSR1
Bend6p24.3Početak7,268,306 bp[1]
Kraj7,347,446 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za SSR1
Genomska lokacija za SSR1
Bend13|13 A3.3Početak38,150,581 bp[2]
Kraj38,178,193 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
Endoplazmatski retikulum
Biološki proces IRE1-mediated unfolded protein response
cotranslational protein targeting to membrane
positive regulation of cell population proliferation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001292008
NM_003144

NM_025965
NM_001360842

RefSeq (bjelančevina)

NP_001278937
NP_003135

NP_080241
NP_001347771

Lokacija (UCSC)Chr 6: 7.27 – 7.35 MbChr 13: 38.15 – 38.18 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Podjedinica alfa translokonu pridruženog proteina jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SSR1.[5]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 286 aminokiselina, а molekulska težina 32.235 Da.[6]

1020304050
MRLLPRLLLLLLLVFPATVLFRGGPRGLLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDE
DDEAEVEEDEPTDLVEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNI
VKFLVGFTNKGTEDFIVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQR
QATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTVIERE
DGLDGETIFMYMFLAGLGLLVIVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSSQND
VDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Receptor signalne sekvence (SSR) je glikozilirani endoplazmatski retikulum (ER), membranski receptor povezan s translokacijom proteina preko membrane ER. SSR se sastoji od dvije podjedinice, 34-kD glikoproteina kodiranog ovim genom i 22-kD-skog glikoproteina. Ovaj gen stvara nekoliko tipova iRNK, kao rezultat složene alternativne poliadenilacije. Ovaj gen je neobičan po tome što koristi sekvence poliA signalnih sekvenci koje su isključivo nekanonske.[5]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124783 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021427 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: SSR1 signal sequence receptor, alpha (translocon-associated protein alpha)".
  6. ^ "UniProt, P43307" (jezik: engleski). Pristupljeno 5. 10. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]