Idi na sadržaj

TFF3

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TFF3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1E9T, 1PE3

Identifikatori
AliasiTFF3
Vanjski ID-jeviOMIM: 600633 MGI: 104638 HomoloGene: 2427 GeneCards: TFF3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 21 (čovjek)
Hrom.Hromosom 21 (čovjek)[1]
Hromosom 21 (čovjek)
Genomska lokacija za TFF3
Genomska lokacija za TFF3
Bend21q22.3Početak42,311,667 bp[1]
Kraj42,315,409 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 17 (miš)
Hrom.Hromosom 17 (miš)[2]
Hromosom 17 (miš)
Genomska lokacija za TFF3
Genomska lokacija za TFF3
Bend17 A3.3|17 15.8 cMPočetak31,344,280 bp[2]
Kraj31,348,620 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
molekularna funkcija
Ćelijska komponenta citoplazma
Vanćelijsko
extracellular region
secretory granule
Biološki proces Zarastanje rana
regulation of glucose metabolic process
maintenance of gastrointestinal epithelium
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003226

NM_011575

RefSeq (bjelančevina)

NP_003217

NP_035705

Lokacija (UCSC)Chr 21: 42.31 – 42.32 MbChr 17: 31.34 – 31.35 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Trefoilski faktor 3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TFF3 sa hromosoma 21.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 80 aminokiselina, a molekulska težina 8.641 Da.[7]

1020304050
MAARALCMLGLVLALLSSSSAEEYVGLSANQCAVPAKDRVDCGYPHVTPK
ECNNRGCCFDSRIPGVPWCFKPLQEAECTF

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Članovi trefoilske porodice odlikuju se po tome što imaju najmanje jednu kopiju motiv trefoila, domen od 40 aminokiselina koji sadrži tri konzervirane disulfidne veze. Oni su stabilni sekretorni proteini koji se eksprimiraju u gastrointestinalnoj sluznici. Njihove funkcije su raznolike, uključujući zaštitu sluznica, zgušnjavanje sluzi i povećanje brzine zacjeljivanja epitela. Ovaj gen je marker cilindrićnog epitela i eksprimiran je u različitim tkivima uključujući peharaste ćelije crijeva, uključujućij debelo crijevo. Ovaj gen i dva druga srodna gena člana porodice trefoila nalaze se u klastru na hromosomu 21.[7]

Vezivanje glikana

[uredi | uredi izvor]

Svi ljudski faktori trefoila su lektini koji specifično djeluju sa disaharidom GlcNAc-α-1,4-Gal.[8] Ovaj disaharid je neobičan glikotop za koji se zna da postoji samo na velikim, jako glikozilovanim, mucinima u sluznicama. Unakrsnim povezivanjem mucina putem dvovalentnog vezivanja ovog glikotopa, trefoilski faktori su tada u stanju da reverzibilno moduliraju debljinu i viskoznost sluzi.[8]

U majčinom mlijeku

[uredi | uredi izvor]

Faktori trefoila (TFF) su sekretorni proizvodi ćelija koji proizvode mucin. Oni imaju ključnu ulogu u održavanju površinskog integriteta usne sluznice i poboljšavaju zacjeljivanje gastrointestinalne sluznice, procesom koji se naziva restitucija. TFF sastoji se od želudačnih peptida (TFF1), spazmolitskog peptida (TFF2) i intestinalnog trefoilskog faktora (TFF3, ovaj protein). Imaju važnu i neophodnu ulogu u restituciji epitela u gastrointestinalnom traktu. Značajne količine TFF-a prisutne su u majčinom mlijeku. Predstavljeni su dokazi da TFF3 izolovan iz mlijeka snažno korelira sa smanjenom regulacijom IL-6 i IL-8 u ljudskim intestinalnim epitelnim ćelijama. S druge strane, TFF3 je aktivirao epitelne ćelije u kulturi da proizvedu beta defenzine 2 (hBD2) i beta defenzine 4 (hBD4). Ovi nalazi sugeriraju da TFF može aktivirati crijevne epitelne ćelije i da može aktivno sudjelovati u imunskom sistemu dojenih beba, indukcijom proizvodnje peptida povezanih s urođenom odbranom, kao što su defenzini.[9]

Aktivacija PAR-2 receptora

[uredi | uredi izvor]

Dva glavna mehanizma opisana su za aktivaciju PAR-2: (A) specifičnim cijepanjem zademaskiranje peptidne sekvencu koja aktivira receptore u vanćelijskom N-terminalnom domenu svakog PAR-a, što dovodi do ćelijske signalizacije putem interakcije izloženih vezanih liganda sa tijelom samog receptora i (B) sintetskim peptidima, kao što je SLIGKV, koji se vezuju za receptor, oponašajući djelovanje agonističkih proteaza.[10]Tokom dojenja, TFF3 izlučen u ljudskom mlijeku može aktivirati crijevne epitelne ćelije preko PAR-2 receptora, što zauzvrat inducira ekspresiju hBD2 i hBD4 i regulaciju citokina.[10]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Koristeći TFF3 kao marker cilindričnog epitela, razvijen je proces koji koristi uređaj za uzimanje uzoraka iz jednjaka (Citospong) u kombinaciji s imunocitohemijskom obradom za trefoiski faktor 3, kako bi se poboljšala tačnost i prihvatljivost detekcije/skrininga Barrettovog jednjaka.[11] Međutim, klinička korist takvog testa može biti ograničena čestim bojenjem TFF3 u kardiju želuca i kasnijim rizikom od lažno pozitivnih rezultata.[12]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160180 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024029 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Thim L, Woldike HF, Nielsen PF, Christensen M, Lynch-Devaney K, Podolsky DK (May 1995). "Characterization of human and rat intestinal trefoil factor produced in yeast". Biochemistry. 34 (14): 4757–64. doi:10.1021/bi00014a033. PMID 7718582.
  6. ^ Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (May 1997). "Human trefoil peptides: genomic structure in 21q22.3 and coordinated expression". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.
  7. ^ a b c "Entrez Gene: TFF3 trefoil factor 3 (intestinal)".
  8. ^ a b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (May 2020). "Trefoil factors share a lectin activity that defines their role in mucus". Nature Communications. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038/s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.
  9. ^ Barrera GJ, Sanchez G, Gonzalez JE (November 2012). "Trefoil factor 3 isolated from human breast milk downregulates cytokines (IL8 and IL6) and promotes human beta defensin (hBD2 and hBD4) expression in intestinal epithelial cells HT-29". Bosn J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. doi:10.17305/bjbms.2012.2448. PMC 4362502. PMID 23198942.
  10. ^ a b Barrera GJ, Tortolero GS (2016). "Trefoil factor 3 (TFF3) from human breast milk activates PAR-2 receptors, of the intestinal epithelial cells HT-29, regulating cytokines and defensins". Bratislavské LekáRske Listy. 117 (6): 332–9. doi:10.4149/bll_2016_066. PMID 27546365.
  11. ^ Kadri SR, Lao-Sirieix P, O'Donovan M, Debiram I, Das M, Blazeby JM, Emery J, Boussioutas A, Morris H, Walter FM, Pharoah P, Hardwick RH, Fitzgerald RC (2010). "Acceptability and accuracy of a non-endoscopic screening test for Barrett's oesophagus in primary care: cohort study". BMJ. 341: c4372. doi:10.1136/bmj.c4372. PMC 2938899. PMID 20833740.
  12. ^ Peitz U, Kouznetsova I, Wex T, Gebert I, Vieth M, Roessner A, Hoffmann W, Malfertheiner P (2004). "TFF3 expression at the esophagogastric junction is increased in gastro-esophageal reflux disease (GERD)". Peptides. 25 (5): 771–7. doi:10.1016/j.peptides.2004.01.018. PMID 15177871. S2CID 23122603.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]