Apaf-1

APAF1
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW, 3JBT
Identificadors
Àlies	APAF1, APAF-1, CED4, apoptotic peptidase activating factor 1
IDs externes	OMIM: 602233   MGI: 1306796   HomoloGene: 7626   GeneCards: APAF1   OMA: APAF1 - orthologs
Localització del gen (humà) Crom. Cromosoma 12 (humà)[1] Banda 12q23.1 Inici 98.645.290 bp[1] Fi 98.735.433 bp[1]
Localització del gen (ratolí) Crom. Cromosoma 10 (ratolí)[2] Banda 10 C2|10 45.47 cM Inici 90.989.311 bp[2] Fi 91.082.770 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN Bgee Humà Ratolí (ortòleg) Més explicacions monòcit ventricular zone  sang bone marrow cells  eminència ganglionar  epithelium of colon  granulòcit tendó d'Aquil·les os esponjós testicle Més explicacions granulòcit derma migratory enteric neural crest cell  urèter jejú conducte deferent otic vesicle  stroma of bone marrow  gastrula  ili Més dades d'expressió de referència BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular heat shock protein binding  ADP binding  unió proteica  unió de proteïnes idèntica  unió d'ATP  unió de nucleòtids  cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process  Component cel·lular citoplasma  citosol  exosoma extracel·lular  nucli cel·lular  apoptosome  regió extracel·lular  secretory granule lumen  ficolin-1-rich granule lumen  complex macromolecular  Procés biològic cellular response to transforming growth factor beta stimulus  neuron apoptotic process  regulation of apoptotic process  diferenciació cel·lular  response to hypoxia  response to nutrient  response to G1 DNA damage checkpoint signaling  envelliment humà  positive regulation of apoptotic signaling pathway  glial cell apoptotic process  desenvolupament neuronal  desenvolupament d'organisme multicel·lular  cardiac muscle cell apoptotic process  intrinsic apoptotic signaling pathway  intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress  neural tube closure  brain development  positive regulation of apoptotic process  apoptotic signaling pathway  forebrain development  regulation of apoptotic DNA fragmentation  protein homooligomerization  activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process  activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c  apoptosi  neutrophil degranulation  negative regulation of G0 to G1 transition  kidney development  Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 317 11783 Ensembl ENSG00000120868 ENSMUSG00000019979 UniProt O14727 O88879 RefSeq (ARNm) NM_001160 NM_013229 NM_181861 NM_181868 NM_181869 NM_001042558 NM_001282947 NM_009684 RefSeq (proteïna) NP_001151 NP_037361 NP_863651 NP_863658 NP_863659 NP_001036023 NP_001269876 NP_033814 Localització (UCSC) Chr 12: 98.65 – 98.74 Mb Chr 10: 90.99 – 91.08 Mb Cerca a PubMed [3] [4]
Wikidata
Veure/Editar Humà Veure/Editar Ratolí

Apoptotic peptidase activating factor 1

Substància	proteïna
Identificadors
Símbol	CED4
HUGO	576
Entrez	317
OMIM	602233
RefSeq	NM_181861.1
O14727
PDB	1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW i 3JBT

La proteïna Apaf-1 (Apoptosis protease-activating factor-1) és un regulador clau de la via apoptòtica mitocondrial, sent l'element central del complex multimèric anomenat apoptosoma, format també per la procaspasa-9 i el citocrom c.

Les activitats Apaf es van descriure per primera vegada en experiments in vitro per recuperar l'activitat caspasa a partir de fraccions citosòliques de cèl·lules HeLa. Apaf-1 va resultar ser una molècula adaptadora amb homologia amb la proteïna CED-4 de C. elegans, mentre que Apaf-2 i Apaf-3 van ser identificats com el citocrom ci la caspasa-9 respectivament (Zou et al. 1997).

La formació de l'estructura de l'apoptosoma es desencadena amb l'alliberament del mitocondri del citocrom c intervingut per la família Bcl-2. Un cop alliberat, el citocrom c s'uneix a Apaf-1 formant un primer complex. Aquesta unió ve definida per l'existència en l'extrem C-terminal d'Apaf-1 de diversos dominis WD40 d'unió proteïna-proteïna com els presents en la subunitat b de les proteïnes G heterotrimèriques. Apaf-1 presenta també un domini de reclutament de caspases (CARD) que, en condicions d'inactivitat, estaria "segrestat" per dos dels dominis WD40, però que s'allibera amb la unió del citocrom c. L'exposició dels dominis CARD permet a Apaf-1 reclutar la procaspasa-9 en presència de dATP que intervé l'oligomerització del complex. Un cop unida, la procaspasa-9 té un autoprocessament donant lloc a la seva forma activa de caspasa-9, una caspasa iniciadora capaç d'activar caspases efectores com la caspasa-3. Aquesta successió d'esdeveniments acaba desembocant en l'activació d'altres caspases i de factors de degradació d'ADN que s'encarregarien de fragmentar el material genètic.

• Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X. Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3. Cell 1997 Aug 8;90(3):405-13. PMID: 9267021.

• Yoshida H, Kong YY, Yoshida R, Elia AJ, Hakem A, Hakem R, Penninger JM, Mak TW. Apaf1 is required for mitochondrial pathways of apoptosis and brain development. Cell. 1998 Sep 18;94(6):739-50. PMID: 9753321.

• Danial NN, Korsmeyer SJ. Cell death: critical control points. Cell 2004 Jan 23;116 (2):205-19. PMID: 14744432.

• APAF1 (Apoptotic protease activating factor 1) Arxivat 2005-10-25 a Wayback Machine.