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Cadeia codogênica

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Quando se refere à transcrição de DNA, a cadeia de codificação ou cadeia codogênica é a cadeia de DNA cuja sequência de bases corresponde à sequência de bases do transcrito de RNA produzido (embora com timina substituída por uracila). É esta cadeia que contém códons, enquanto a cadeia não-codificante contém anticódons. Durante a transcrição, a RNA Pol II liga-se à cadeia não codificante, lê os anticódons e transcreve a sua sequência para sintetizar o transcrito de RNA com bases complementares.

Por convenção, a cadeia de codificação é a cadeia usada para exibir uma sequência de DNA. É apresentado na direção 5' a 3'.

Termos alternativos para cadeias

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Onde quer que exista um gene numa molécula de DN|, uma cadeia é a cadeia codificante (ou cadeia de sentido) e a outra é a cadeia não codificante (também denominada cadeia antisentido,[1] cadeia anticódica, cadeia modelo ou cadeia transcrita).

Cadeias na bolha de transcrição

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Durante transcrição, RNA polimerase desenrola uma pequena seção da dupla hélice de DNA perto do início do gene (o sítio de início da transcrição). Esta seção desenrolada é conhecida como bolha de transcrição. A RNA polimerase, e com ela a bolha de transcrição, viaja ao longo da cadeia não codificadora na direção oposta, direção 3' a 5', bem como polimeriza uma vertente recém-sintetizada em 5' a 3' ou direção a jusante. A dupla hélice de DNA é re-espiralada RNA polimerase na parte traseira da bolha de transcrição.[1] Assim como dois zíperes adjacentes funcionam, quando puxados juntos, eles descompactam e recompactam, à medida que prosseguem em uma direção específica. Vários fatores podem causar a quebra da cadeia dupla de DNA; então, reordenar genes ou causar morte celular.[2]

Híbrido RNA-DNA

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Onde a hélice é desenrolada, a cadeia de codificação consiste em bases não emparelhadas, enquanto a cadeia modelo consiste em um composto de RNA: DNA, seguido por um número de bases desemparelhadas na parte traseira. Este híbrido consiste nos mais recentemente adicionados nucleotídeo do transcrito de RNA, emparelhado complementarmente com a cadeia modelo. O número de pares de bases no híbrido está sob investigação, mas foi sugerido que o híbrido seja formado a partir dos últimos 10 nucleotídeos adicionados.[3]

Referências

  1. a b Lewin, Benjamin (2008). Genes IX. [S.l.]: Oxford University Press. p. 129, 235. ISBN 978-0-7637-4063-4 
  2. Dianatpour A, Ghafouri-Fard S (2017). «The Role of Long Non Coding RNAs in the Repair of DNA Double Strand Breaks». Int J Mol Cell Med. 6 (1): 1–12. PMC 5568187Acessível livremente. PMID 28868264 
  3. Griffiths 2005, pp. 259–265
  • Griffiths, A.J.F.; et al. (2005). Introduction to Genetic Analysis 8th ed. [S.l.]: W.H. Freeman. ISBN 0-7167-4939-4 
  • Lewin, B. (2000). Genes VII. New York: Oxford University Press. ISBN 0-19-879277-8