BPI (ген)

BPI
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BP1, 1EWF
Ідентифікатори
Символи	BPI, bactericidal/permeability-increasing protein, BPIFD1, rbactericidal permeability increasing protein
Зовнішні ІД	OMIM: 109195 MGI: 3045315 HomoloGene: 37519 GeneCards: BPI
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid binding; • lipopolysaccharide binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • мембрана; • цитоплазма; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • міжклітинний простір; • azurophil granule lumen; • specific granule lumen; • cytoplasmic stress granule;
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-6 production; • negative regulation of interleukin-8 production; • defense response to bacterium; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • negative regulation of macrophage activation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • antimicrobial humoral response; • neutrophil degranulation; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	671
	329547
	ENSG00000101425
	ENSMUSG00000052922
	P17213
	Q67E05
	NM_001725
	NM_177850; NM_001356542
	NP_001716
	NP_808518; NP_001343471
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BPI (англ. Bactericidal/permeability-increasing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 53 900^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRENMARGPC	NAPRWASLMV	LVAIGTAVTA	AVNPGVVVRI	SQKGLDYASQ
QGTAALQKEL	KRIKIPDYSD	SFKIKHLGKG	HYSFYSMDIR	EFQLPSSQIS
MVPNVGLKFS	ISNANIKISG	KWKAQKRFLK	MSGNFDLSIE	GMSISADLKL
GSNPTSGKPT	ITCSSCSSHI	NSVHVHISKS	KVGWLIQLFH	KKIESALRNK
MNSQVCEKVT	NSVSSELQPY	FQTLPVMTKI	DSVAGINYGL	VAPPATTAET
LDVQMKGEFY	SENHHNPPPF	APPVMEFPAA	HDRMVYLGLS	DYFFNTAGLV
YQEAGVLKMT	LRDDMIPKES	KFRLTTKFFG	TFLPEVAKKF	PNMKIQIHVS
ASTPPHLSVQ	PTGLTFYPAV	DVQAFAVLPN	SSLASLFLIG	MHTTGSMEVS
AESNRLVGEL	KLDRLLLELK	HSNIGPFPVE	LLQDIMNYIV	PILVLPRVNE
KLQKGFPLPT	PARVQLYNVV	LQPHQNFLLF	GADVVYK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beamer L.J., Carroll S.F., Eisenberg D. (1997). Crystal structure of human BPI and two bound phospholipids at 2.4-A resolution. Science. 276: 1861—1864. PMID 9188532 DOI:10.1126/science.276.5320.1861
Kleiger G., Beamer L.J., Grothe R., Mallick P., Eisenberg D. (2000). The 1.7 A crystal structure of BPI: a study of how two dissimilar amino acid sequences can adopt the same fold. J. Mol. Biol. 299: 1019—1034. PMID 10843855 DOI:10.1006/jmbi.2000.3805
Wasiluk K.R., Skubitz K.M., Gray B.H. (1991). Comparison of granule proteins from human polymorphonuclear leukocytes which are bactericidal toward Pseudomonas aeruginosa. Infect. Immun. 59: 4193—4200. PMID 1937776
Ooi C.E., Weiss J., Elsbach P., Frangione B., Mannion B. (1987). A 25-kDa NH2-terminal fragment carries all the antibacterial activities of the human neutrophil 60-kDa bactericidal/permeability-increasing protein. J. Biol. Chem. 262: 14891—14894. PMID 3667613

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1095 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P17213 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1095 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P17213 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

BPI (ген)

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук