Idi na sadržaj

ZRF1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
ZRF1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2M2E

Identifikatori
AliasiDNAJC2
Vanjski ID-jeviOMIM: 605502 MGI: 99470 HomoloGene: 31656 GeneCards: DNAJC2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za ZRF1
Genomska lokacija za ZRF1
Bend7q22.1Početak103,312,289 bp[1]
Kraj103,344,830 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za ZRF1
Genomska lokacija za ZRF1
Bend5 A3|5 9.97 cMPočetak21,962,265 bp[2]
Kraj21,990,249 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
Hsp70 protein binding
GO:0031493 histone binding
chromatin binding
ATPase activator activity
vezivanje sa RNK
ubiquitin modification-dependent histone binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
Jedarna membrana
jedro
nukleoplazma
Biološki proces GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of cellular response to heat
Replikacija DNK
'de novo' cotranslational protein folding
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA biosynthetic process
transcription, DNA-templated
positive regulation of ATP-dependent activity
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001129887
NM_014377
NM_001362667
NM_001362668

NM_009584

RefSeq (bjelančevina)

NP_001123359
NP_055192
NP_001349596
NP_001349597

NP_033610

Lokacija (UCSC)Chr 7: 103.31 – 103.34 MbChr 5: 21.96 – 21.99 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Član 2 potorodice DnaJ homologa C je protein koji je kod ljudi kodiran genom DNAJC2.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 621 aminokiselina, а molekulska težina 71.996 Da.[7]

1020304050
MLLLPSAADGRGTAITHALTSASTLCQVEPVGRWFEAFVKRRNRNASASF
QELEDKKELSEESEDEELQLEEFPMLKTLDPKDWKNQDHYAVLGLGHVRY
KATQRQIKAAHKAMVLKHHPDKRKAAGEPIKEGDNDYFTCITKAYEMLSD
PVKRRAFNSVDPTFDNSVPSKSEAKDNFFEVFTPVFERNSRWSNKKNVPK
LGDMNSSFEDVDIFYSFWYNFDSWREFSYLDEEEKEKAECRDERRWIEKQ
NRATRAQRKKEEMNRIRTLVDNAYSCDPRIKKFKEEEKAKKEAEKKAKAE
AKRKEQEAKEKQRQAELEAARLAKEKEEEEVRQQALLAKKEKDIQKKAIK
KERQKLRNSCKTWNHFSDNEAERVKMMEEVEKLCDRLELASLQCLNETLT
SCTKEVGKAALEKQIEEINEQIRKEKEEAEARMRQASKNTEKSTGGGGNG
SKNWSEDDLQLLIKAVNLFPAGTNSRWEVIANYMNIHSSSGVKRTAKDVI
GKAKSLQKLDPHQKDDINKKAFDKFKKEHGVVPQADNATPSERFEGPYTD
FTPWTTEEQKLLEQALKTYPVNTPERWEKIAEAVPGRTKKDCMKRYKELV
EMVKAKKAAQEQVLNASRAKK

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen je član porodice fosfoproteinskih gena M-faze (MPP). Kodira fosfoprotein s J domenom i domenom koji veže Myb DNK, koja se nalazi i u jedru i u citosolu. Protein je sposoban formirati heterodimerni kompleks koji se povezuje s ribosomima, djelujući kao molekulski šaperon za novonastale polipeptidne lance pri izlasku iz ribosoma. Ovaj protein je identificiran kao leukemija-povezani antigen, a ekspresija gena je povećana u leukemijskim blastima. Također, hromosomske aberacije koje uključuju ovaj gen povezane su s primarnim pločastim ćelijama tumora glave i vrata. Ovaj gen ima pseudogen na hromosomu 6. Opisane su alternativno prerađene varijante koje kodiraju različite izoforme proteina; međutim, sve varijante nisu u potpunosti okarakterizirane.[6]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105821 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029014 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (Jan 1997). "Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning". Mol Biol Cell. 7 (9): 1455–69. doi:10.1091/mbc.7.9.1455. PMC 275994. PMID 8885239.
  6. ^ a b "Entrez Gene: ZRF1 zuotin related factor 1".
  7. ^ "UniProt, Q99543" (jezik: engleski). Pristupljeno 27. 9. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]