Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ARID3A
Ідентифікатори
Символи
ARID3A , BRIGHT, DRIL1, DRIL3, E2FBP1, AT-rich interaction domain 3A
Зовнішні ІД
OMIM : 603265 MGI: 1328360 HomoloGene: 124247 GeneCards: ARID3A
Онтологія гена
Молекулярна функція
• protein homodimerization activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• membrane raft • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 0.93 – 0.98 Mb
Хр. 10: 79.76 – 79.79 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ARID3A (англ. AT-rich interaction domain 3A ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот , а молекулярна маса — 62 889[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKLQAVMETL LQRQQRARQE LEARQQLPPD PPAAPPGRAR AAPDEDREPE
SARMQRAQMA ALAAMRAAAA GLGHPASPGG SEDGPPGSEE EDAAREGTPG
SPGRGREGPG EEHFEDMASD EDMKPKWEEE EMEEDLGEDE EEEEEDYEDE
EEEEDEEGLG PPGPASLGTT ALFPRKAQPP QAFRGDGVPR VLGGQERPGP
GPAHPGGAAH VAPQLQPPDH GDWTYEEQFK QLYELDGDPK RKEFLDDLFS
FMQKRGTPVN RIPIMAKQVL DLFMLYVLVT EKGGLVEVIN KKLWREITKG
LNLPTSITSA AFTLRTQYMK YLYPYECEKR GLSNPNELQA AIDSNRREGR
RQSFGGSLFA YSPGGAHGML SSPKLPVSSL GLAASTNGSS ITPAPKIKKE
EDSAIPITVP GRLPVSLAGH PVVAAQAAAV QAAAAQAAVA AQAAALEQLR
EKLESAEPPE KKMALVADEQ QRLMQRALQQ NFLAMAAQLP MSIRINSQAS
ESRQDSAVNL TGTNGSNSIS MSVEINGIMY TGVLFAQPPA PTPTSAPNKG
GGGGGGSSSN AGGRGGNTGT SGGQAGPAGL STPSTSTSNN SLP
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Kim D., Probst L., Das C., Tucker P.W. (2007). REKLES is an ARID3-restricted multifunctional domain. J. Biol. Chem . 282 : 15768—15777. PMID 17400556 DOI :10.1074/jbc.M700397200
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Ци��кові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші