Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MTF1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| MTF1, MTF-1, ZRF, metal-regulatory transcription factor 1, metal regulatory transcription factor 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600172 MGI: 101786 HomoloGene: 4347 GeneCards: MTF1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
гіпотиреоз[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• response to cadmium ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to metal ion • GO:0001306 response to oxidative stress • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • central nervous system development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 37.81 – 37.86 Mb
| Хр. 4: 124.7 – 124.74 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
MTF1 (англ. Metal regulatory transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 80 957[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEHSPDNNI | | IYFEAEEDEL | | TPDDKMLRFV | | DKNGLVPSSS | | GTVYDRTTVL |
IEQDPGTLED | | EDDDGQCGEH | | LPFLVGGEEG | | FHLIDHEAMS | | QGYVQHIISP |
DQIHLTINPG | | STPMPRNIEG | | ATLTLQSECP | | ETKRKEVKRY | | QCTFEGCPRT |
YSTAGNLRTH | | QKTHRGEYTF | | VCNQEGCGKA | | FLTSYSLRIH | | VRVHTKEKPF |
ECDVQGCEKA | | FNTLYRLKAH | | QRLHTGKTFN | | CESEGCSKYF | | TTLSDLRKHI |
RTHTGEKPFR | | CDHDGCGKAF | | AASHHLKTHV | | RTHTGERPFF | | CPSNGCEKTF |
STQYSLKSHM | | KGHDNKGHSY | | NALPQHNGSE | | DTNHSLCLSD | | LSLLSTDSEL |
RENSSTTQGQ | | DLSTISPAII | | FESMFQNSDD | | TAIQEDPQQT | | ASLTESFNGD |
AESVSDVPPS | | TGNSASLSLP | | LVLQPGLSEP | | PQPLLPASAP | | SAPPPAPSLG |
PGSQQAAFGN | | PPALLQPPEV | | PVPHSTQFAA | | NHQEFLPHPQ | | APQPIVPGLS |
VVAGASASAA | | AVASAVAAPA | | PPQSTTEPLP | | AMVQTLPLGA | | NSVLTNNPTI |
TITPTPNTAI | | LQSSLVMGEQ | | NLQWILNGAT | | SSPQNQEQIQ | | QASKVEKVFF |
TTAVPVASSP | | GSSVQQIGLS | | VPVIIIKQEE | | ACQCQCACRD | | SAKERASSRR |
KGCSSPPPPE | | PSPQAPDGPS | | LQLPAQTFSS | | APVPGSSSST | | LPSSCEQSRQ |
AETPSDPQTE | | TLSAMDVSEF | | LSLQSLDTPS | | NLIPIEALLQ | | GEEEMGLTSS |
FSK |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|