Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ARNTL2
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| ARNTL2, BMAL2, CLIF, MOP9, PASD9, bHLHe6, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 614517 MGI: 2684845 HomoloGene: 10609 GeneCards: ARNTL2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • E-box binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of circadian rhythm • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • циркадний ритм • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ритмічний процес • entrainment of circadian clock
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 27.33 – 27.43 Mb
| Хр. 6: 146.7 – 146.74 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
ARNTL2 (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 636 амінокислот, а молекулярна маса — 70 887[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAEEEAAAG | | GKVLREENQC | | IAPVVSSRVS | | PGTRPTAMGS | | FSSHMTEFPR |
KRKGSDSDPS | | QSGIMTEKVV | | EKLSQNPLTY | | LLSTRIEISA | | SSGSRVEDGE |
HQVKMKAFRE | | AHSQTEKRRR | | DKMNNLIEEL | | SAMIPQCNPM | | ARKLDKLTVL |
RMAVQHLRSL | | KGLTNSYVGS | | NYRPSFLQDN | | ELRHLILKTA | | EGFLFVVGCE |
RGKILFVSKS | | VSKILNYDQA | | SLTGQSLFDF | | LHPKDVAKVK | | EQLSSFDISP |
REKLIDAKTG | | LQVHSNLHAG | | RTRVYSGSRR | | SFFCRIKSCK | | ISVKEEHGCL |
PNSKKKEHRK | | FYTIHCTGYL | | RSWPPNIVGM | | EEERNSKKDN | | SNFTCLVAIG |
RLQPYIVPQN | | SGEINVKPTE | | FITRFAVNGK | | FVYVDQRATA | | ILGYLPQELL |
GTSCYEYFHQ | | DDHNNLTDKH | | KAVLQSKEKI | | LTDSYKFRAK | | DGSFVTLKSQ |
WFSFTNPWTK | | ELEYIVSVNT | | LVLGHSEPGE | | ASFLPCSSQS | | SEESSRQSCM |
SVPGMSTGTV | | LGAGSIGTDI | | ANEILDLQRL | | QSSSYLDDSS | | PTGLMKDTHT |
VNCRSMSNKE | | LFPPSPSEMG | | ELEATRQNQS | | TVAVHSHEPL | | LSDGAQLDFD |
ALCDNDDTAM | | AAFMNYLEAE | | GGLGDPGDFS | | DIQWTL |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|