Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBPL2
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| TBPL2, TBP2, TRF3, TATA-box binding protein like 2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 608964 MGI: 2684058 HomoloGene: 133152 GeneCards: TBPL2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
|
---|
Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 14: 55.41 – 55.46 Mb
| Хр. 2: 23.96 – 23.99 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
TBPL2 (англ. TATA-box binding protein like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот, а молекулярна маса — 41 524[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASAPWPERV | | PRLLAPRLPS | | YPPPPPTVGL | | RSMEQEETYL | | ELYLDQCAAQ |
DGLAPPRSPL | | FSPVVPYDMY | | ILNASNPDTA | | FNSNPEVKET | | SGDFSSVDLS |
FLPDEVTQEN | | KDQPVISKHE | | TEENSESQSP | | QSRLPSPSEQ | | DVGLGLNSSS |
LSNSHSQLHP | | GDTDSVQPSP | | EKPNSDSLSL | | ASITPMTPMT | | PISECCGIVP |
QLQNIVSTVN | | LACKLDLKKI | | ALHAKNAEYN | | PKRFAAVIMR | | IREPRTTALI |
FSSGKMVCTG | | AKSEEQSRLA | | ARKYARVVQK | | LGFPARFLDF | | KIQNMVGSCD |
VRFPIRLEGL | | VLTHQQFSSY | | EPELFPGLIY | | RMVKPRIVLL | | IFVSGKVVLT |
GAKERSEIYE | | AFENIYPILK | | GFKKA |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|