Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SP7
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| SP7, OI11, OI12, OSX, osterix, Sp7 transcription factor |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 606633 MGI: 2153568 HomoloGene: 15607 GeneCards: SP7
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
osteogenesis imperfecta type 12[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • цитоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hematopoietic stem cell differentiation • positive regulation of stem cell differentiation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 53.33 – 53.35 Mb
| Хр. 15: 102.27 – 102.28 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
SP7 (англ. Sp7 transcription factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 44 718[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASSLLEEEA | | HYGSSPLAML | | TAACSKFGGS | | SPLRDSTTLG | | KGGTKKPYAD |
LSAPKTMGDA | | YPAPFSSTNG | | LLSPAGSPPA | | PASGYANDYP | | PFPHSFPGPT |
GAQDPGLLVP | | KGHSSSDCLP | | SVYTSLDMTH | | PYGSWYKAGI | | HAGISPGPGN |
TPTPWWDMHP | | GGNWLGGGQG | | QGDGLQGTLS | | TGPAQPPLNP | | QLPTYPSDFA |
PLNPAPYPAP | | HLLQPGPQHV | | LPQDVYKPKA | | VGNSGQLEGS | | GAAKPPRGAG |
TGGSGGYAGS | | GAGRSTCDCP | | NCQELERLGA | | AAAGLRKKPI | | HSCHIPGCGK |
VYGKASHLKA | | HLRWHTGERP | | FVCNWLFCGK | | RFTRSDELER | | HVRTHTREKK |
FTCLLCSKRF | | TRSDHLSKHQ | | RTHGEPGPGP | | PPSGPKELGE | | GRSVGEEEAN |
QPPRSSTSPA | | PPEKAHGGSP | | EQSNLLEI |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Sinha K.M., Yasuda H., Coombes M.M., Dent S.Y., de Crombrugghe B. (2010). Regulation of the osteoblast-specific transcription factor Osterix by NO66, a Jumonji family histone demethylase. EMBO J. 29: 68—79. PMID 19927124 DOI:10.1038/emboj.2009.332
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|