Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXC13
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HOXC13, ECTD9, HOX3, HOX3G, homeobox C13 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 142976 MGI: 99560 HomoloGene: 7770 GeneCards: HOXC13
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
pure hair-nail type ectodermal dysplasia[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• hair follicle development • multicellular organism development • nail development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • tongue morphogenesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 53.94 – 53.95 Mb
| Хр. 15: 102.83 – 102.84 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
HOXC13 (англ. Homeobox C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 379[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTSLLLHPR | | WPESLMYVYE | | DSAAESGIGG | | GGGGGGGGTG | | GAGGGCSGAS |
PGKAPSMDGL | | GSSCPASHCR | | DLLPHPVLGR | | PPAPLGAPQG | | AVYTDIPAPE |
AARQCAPPPA | | PPTSSSATLG | | YGYPFGGSYY | | GCRLSHNVNL | | QQKPCAYHPG |
DKYPEPSGAL | | PGDDLSSRAK | | EFAFYPSFAS | | SYQAMPGYLD | | VSVVPGISGH |
PEPRHDALIP | | VEGYQHWALS | | NGWDSQVYCS | | KEQSQSAHLW | | KSPFPDVVPL |
QPEVSSYRRG | | RKKRVPYTKV | | QLKELEKEYA | | ASKFITKEKR | | RRISATTNLS |
ERQVTIWFQN | | RRVKEKKVVS | | KSKAPHLHST |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|