Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
GABPA
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| GABPA, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, GA binding protein transcription factor alpha subunit, GA binding protein transcription factor subunit alpha |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600609 MGI: 95610 HomoloGene: 1543 GeneCards: GABPA
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mitochondrion organization • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of megakaryocyte differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cellular response to dopamine • blastocyst formation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 21: 25.73 – 25.77 Mb
| Хр. 16: 84.63 – 84.66 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
GABPA (англ. GA binding protein transcription factor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 295[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTKREAEELI | | EIEIDGTEKA | | ECTEESIVEQ | | TYAPAECVSQ | | AIDINEPIGN |
LKKLLEPRLQ | | CSLDAHEICL | | QDIQLDPERS | | LFDQGVKTDG | | TVQLSVQVIS |
YQGIEPKLNI | | LEIVKPADTV | | EVVIDPDAHH | | AESEAHLVEE | | AQVITLDGTK |
HITTISDETS | | EQVTRWAAAL | | EGYRKEQERL | | GIPYDPIQWS | | TDQVLHWVVW |
VMKEFSMTDI | | DLTTLNISGR | | ELCSLNQEDF | | FQRVPRGEIL | | WSHLELLRKY |
VLASQEQQMN | | EIVTIDQPVQ | | IIPASVQSAT | | PTTIKVINSS | | AKAAKVQRAP |
RISGEDRSSP | | GNRTGNNGQI | | QLWQFLLELL | | TDKDARDCIS | | WVGDEGEFKL |
NQPELVAQKW | | GQRKNKPTMN | | YEKLSRALRY | | YYDGDMICKV | | QGKRFVYKFV |
CDLKTLIGYS | | AAELNRLVTE | | CEQKKLAKMQ | | LHGIAQPVTA | | VALATASLQT |
EKDN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|