Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
BCL11B
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| BCL11B, ATL1, ATL1-alpha, ATL1-beta, ATL1-delta, ATL1-gamma, CTIP-2, CTIP2, RIT1, ZNF856B, hRIT1-alpha, B-cell CLL/lymphoma 11B, IMD49, B cell CLL/lymphoma 11B, IDDFSTA, BAF complex component, BAF chromatin remodeling complex subunit SMARCM2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 606558 MGI: 1929913 HomoloGene: 10974 GeneCards: BCL11B
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • neuron projection • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • regulation of neuron differentiation • Нейрогенез • olfactory bulb axon guidance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation in thymus • аксоноґенеза • epithelial cell morphogenesis • thymus development • T cell receptor V(D)J recombination • negative regulation of apoptotic process • transcription by RNA polymerase II • post-embryonic development • positive T cell selection • transcription, DNA-templated • striatal medium spiny neuron differentiation • odontogenesis of dentin-containing tooth • regulation of lipid metabolic process • keratinocyte development • post-embryonic camera-type eye development • central nervous system neuron differentiation • регуляція експресії генів • alpha-beta T cell differentiation • regulation of keratinocyte proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • skin development • hematopoietic stem cell migration • lymphoid lineage cell migration into thymus
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 14: 99.17 – 99.27 Mb
| Хр. 12: 107.88 – 107.97 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
BCL11B (англ. B-cell CLL/lymphoma 11B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 95 519[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRRKQGNPQ | | HLSQRELITP | | EADHVEAAIL | | EEDEGLEIEE | | PSGLGLMVGG |
PDPDLLTCGQ | | CQMNFPLGDI | | LVFIEHKRKQ | | CGGSLGACYD | | KALDKDSPPP |
SSRSELRKVS | | EPVEIGIQVT | | PDEDDHLLSP | | TKGICPKQEN | | IAGPCRPAQL |
PAVAPIAASS | | HPHSSVITSP | | LRALGALPPC | | LPLPCCSARP | | VSGDGTQGEG |
QTEAPFGCQC | | QLSGKDEPSS | | YICTTCKQPF | | NSAWFLLQHA | | QNTHGFRIYL |
EPGPASSSLT | | PRLTIPPPLG | | PEAVAQSPLM | | NFLGDSNPFN | | LLRMTGPILR |
DHPGFGEGRL | | PGTPPLFSPP | | PRHHLDPHRL | | SAEEMGLVAQ | | HPSAFDRVMR |
LNPMAIDSPA | | MDFSRRLREL | | AGNSSTPPPV | | SPGRGNPMHR | | LLNPFQPSPK |
SPFLSTPPLP | | PMPPGGTPPP | | QPPAKSKSCE | | FCGKTFKFQS | | NLIVHRRSHT |
GEKPYKCQLC | | DHACSQASKL | | KRHMKTHMHK | | AGSLAGRSDD | | GLSAASSPEP |
GTSELAGEGL | | KAADGDFRHH | | ESDPSLGHEP | | EEEDEEEEEE | | EEELLLENES |
RPESSFSMDS | | ELSRNRENGG | | GGVPGVPGAG | | GGAAKALADE | | KALVLGKVME |
NVGLGALPQY | | GELLADKQKR | | GAFLKRAAGG | | GDAGDDDDAG | | GCGDAGAGGA |
VNGRGGGFAP | | GTEPFPGLFP | | RKPAPLPSPG | | LNSAAKRIKV | | EKDLELPPAA |
LIPSENVYSQ | | WLVGYAASRH | | FMKDPFLGFT | | DARQSPFATS | | SEHSSENGSL |
RFSTPPGDLL | | DGGLSGRSGT | | ASGGSTPHLG | | GPGPGRPSSK | | EGRRSDTCEY |
CGKVFKNCSN | | LTVHRRSHTG | | ERPYKCELCN | | YACAQSSKLT | | RHMKTHGQIG |
KEVYRCDICQ | | MPFSVYSTLE | | KHMKKWHGEH | | LLTNDVKIEQ | | AERS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|