Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PAX4
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| PAX4, KPD, MODY9, paired box 4 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 167413 MGI: 97488 HomoloGene: 4515 GeneCards: PAX4
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
цукровий діабет тип 1, maturity-onset diabetes of the young type 9[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • retina development in camera-type eye • циркадний ритм • positive regulation of cell differentiation • animal organ morphogenesis • регуляція диференціювання клітин • response to cAMP • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • endocrine pancreas development • pancreas development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 7: 127.61 – 127.62 Mb
| Хр. 6: 28.44 – 28.45 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
PAX4 (англ. Paired box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 37 833[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHQDGISSMN | | QLGGLFVNGR | | PLPLDTRQQI | | VRLAVSGMRP | | CDISRILKVS |
NGCVSKILGR | | YYRTGVLEPK | | GIGGSKPRLA | | TPPVVARIAQ | | LKGECPALFA |
WEIQRQLCAE | | GLCTQDKTPS | | VSSINRVLRA | | LQEDQGLPCT | | RLRSPAVLAP |
AVLTPHSGSE | | TPRGTHPGTG | | HRNRTIFSPS | | QAEALEKEFQ | | RGQYPDSVAR |
GKLATATSLP | | EDTVRVWFSN | | RRAKWRRQEK | | LKWEMQLPGA | | SQGLTVPRVA |
PGIISAQQSP | | GSVPTAALPA | | LEPLGPSCYQ | | LCWATAPERC | | LSDTPPKACL |
KPCWDCGSFL | | LPVIAPSCVD | | VAWPCLDASL | | AHHLIGGAGK | | ATPTHFSHWP |
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|