Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ELF5
|
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/33/Protein_ELF5_PDB_1wwx.png/250px-Protein_ELF5_PDB_1wwx.png) |
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| ELF5, ESE2, E74 like ETS transcription factor 5 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 605169 HomoloGene: 7702 GeneCards: ELF5
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ectodermal cell fate commitment • negative regulation of cell differentiation • диференціація клітин • ectoderm development • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • mammary gland epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/PBB_GE_ELF5_220625_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ELF5_220625_s_at_fs.png)
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7e/PBB_GE_ELF5_220624_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ELF5_220624_s_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 11: 34.48 – 34.53 Mb
| н/д
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
ELF5 (англ. E74 like ETS transcription factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 265 амінокислот, а молекулярна маса — 31 263[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPSLPHSHRV | | MLDSVTHSTF | | LPNASFCDPL | | MSWTDLFSNE | | EYYPAFEHQT |
ACDSYWTSVH | | PEYWTKRHVW | | EWLQFCCDQY | | KLDTNCISFC | | NFNISGLQLC |
SMTQEEFVEA | | AGLCGEYLYF | | ILQNIRTQGY | | SFFNDAEESK | | ATIKDYADSN |
CLKTSGIKSQ | | DCHSHSRTSL | | QSSHLWEFVR | | DLLLSPEENC | | GILEWEDREQ |
GIFRVVKSEA | | LAKMWGQRKK | | NDRMTYEKLS | | RALRYYYKTG | | ILERVDRRLV |
YKFGKNAHGW | | QEDKL |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|