Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RELB
|
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/88/Protein_RELB_PDB_1zk9.png/250px-Protein_RELB_PDB_1zk9.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
Список кодів PDB |
1ZK9, 1ZKA, 2V2T, 3DO7, 3JSS, 3JUZ, 3JV0, 3JV4, 3JV6, 4JGM, 4JHB
| | |
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| RELB, I-REL, IREL, REL-B, RELB proto-oncogene, NF-kB subunit, IMD53 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 604758 MGI: 103289 HomoloGene: 4747 GeneCards: RELB
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• I-kappaB/NF-kappaB complex • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • GO:0009327 protein-containing complex • transcription repressor complex
|
---|
Біологічний процес |
• response to cytokine • antigen processing and presentation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • myeloid dendritic cell differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell differentiation • negative regulation of interferon-beta production • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to osmotic stress • GO:1901313 positive regulation of gene expression • NIK/NF-kappaB signaling • T-helper 1 type immune response • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет • lymphocyte differentiation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e1/PBB_GE_RELB_205205_at_fs.png/250px-PBB_GE_RELB_205205_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 19: 45 – 45.04 Mb
| Хр. 7: 19.34 – 19.36 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
RELB (англ. RELB proto-oncogene, NF-kB subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 62 134[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLRSGPASGP | | SVPTGRAMPS | | RRVARPPAAP | | ELGALGSPDL | | SSLSLAVSRS |
TDELEIIDEY | | IKENGFGLDG | | GQPGPGEGLP | | RLVSRGAASL | | STVTLGPVAP |
PATPPPWGCP | | LGRLVSPAPG | | PGPQPHLVIT | | EQPKQRGMRF | | RYECEGRSAG |
SILGESSTEA | | SKTLPAIELR | | DCGGLREVEV | | TACLVWKDWP | | HRVHPHSLVG |
KDCTDGICRV | | RLRPHVSPRH | | SFNNLGIQCV | | RKKEIEAAIE | | RKIQLGIDPY |
NAGSLKNHQE | | VDMNVVRICF | | QASYRDQQGQ | | MRRMDPVLSE | | PVYDKKSTNT |
SELRICRINK | | ESGPCTGGEE | | LYLLCDKVQK | | EDISVVFSRA | | SWEGRADFSQ |
ADVHRQIAIV | | FKTPPYEDLE | | IVEPVTVNVF | | LQRLTDGVCS | | EPLPFTYLPR |
DHDSYGVDKK | | RKRGMPDVLG | | ELNSSDPHGI | | ESKRRKKKPA | | ILDHFLPNHG |
SGPFLPPSAL | | LPDPDFFSGT | | VSLPGLEPPG | | GPDLLDDGFA | | YDPTAPTLFT |
MLDLLPPAPP | | HASAVVCSGG | | AGAVVGETPG | | PEPLTLDSYQ | | APGPGDGGTA |
SLVGSNMFPN | | HYREAAFGGG | | LLSPGPEAT |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|