Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TOX3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| TOX3, CAGF9, TNRC9, TOX high mobility group box family member 3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 611416 MGI: 3039593 HomoloGene: 18257 GeneCards: TOX3
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
рак молочної залози[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • estrogen response element binding • phosphoprotein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 16: 52.44 – 52.55 Mb
| Хр. 8: 90.97 – 91.07 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
TOX3 (англ. TOX high mobility group box family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 576 амінокислот, а молекулярна маса — 63 342[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDVRFYPAAA | | GDPASLDFAQ | | CLGYYGYSKF | | GNNNNYMNMA | | EANNAFFAAS |
EQTFHTPSLG | | DEEFEIPPIT | | PPPESDPALG | | MPDVLLPFQA | | LSDPLPSQGS |
EFTPQFPPQS | | LDLPSITISR | | NLVEQDGVLH | | SSGLHMDQSH | | TQVSQYRQDP |
SLIMRSIVHM | | TDAARSGVMP | | PAQLTTINQS | | QLSAQLGLNL | | GGASMPHTSP |
SPPASKSATP | | SPSSSINEED | | ADEANRAIGE | | KRAAPDSGKK | | PKTPKKKKKK |
DPNEPQKPVS | | AYALFFRDTQ | | AAIKGQNPNA | | TFGEVSKIVA | | SMWDSLGEEQ |
KQVYKRKTEA | | AKKEYLKALA | | AYRASLVSKA | | AAESAEAQTI | | RSVQQTLAST |
NLTSSLLLNT | | PLSQHGTVSA | | SPQTLQQSLP | | RSIAPKPLTM | | RLPMNQIVTS |
VTIAANMPSN | | IGAPLISSMG | | TTMVGSAPST | | QVSPSVQTQQ | | HQMQLQQQQQ |
QQQQQMQQMQ | | QQQLQQHQMH | | QQIQQQMQQQ | | HFQHHMQQHL | | QQQQQHLQQQ |
INQQQLQQQL | | QQRLQLQQLQ | | HMQHQSQPSP | | RQHSPVASQI | | TSPIPAIGSP |
QPASQQHQSQ | | IQSQTQTQVL | | SQVSIF |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|