Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXA1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| FOXA1, HNF3A, TCF3A, forkhead box A1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 GeneCards: FOXA1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• Мікроворсинки • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • prostate gland stromal morphogenesis • dopaminergic neuron differentiation • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • response to estradiol • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung morphogenesis • glucose homeostasis • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron fate specification • anatomical structure formation involved in morphogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • tube morphogenesis • secretory columnal luminar epithelial cell differentiation involved in prostate glandular acinus development • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • multicellular organism development • prostate gland epithelium morphogenesis • connective tissue development • positive regulation of neuron differentiation • epithelial cell maturation involved in prostate gland development • регуляція експресії генів • lung epithelial cell differentiation • dorsal/ventral neural tube patterning • epithelial-mesenchymal signaling involved in prostate gland development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • respiratory basal cell differentiation • hormone metabolic process • alveolar secondary septum development • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ремоделювання хроматину • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of apoptotic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • диференціація клітин
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 14: 37.59 – 37.6 Mb
| Хр. 12: 57.59 – 57.59 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
FOXA1 (англ. Forkhead box A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 49 148[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLGTVKMEGH | | ETSDWNSYYA | | DTQEAYSSVP | | VSNMNSGLGS | | MNSMNTYMTM |
NTMTTSGNMT | | PASFNMSYAN | | PGLGAGLSPG | | AVAGMPGGSA | | GAMNSMTAAG |
VTAMGTALSP | | SGMGAMGAQQ | | AASMNGLGPY | | AAAMNPCMSP | | MAYAPSNLGR |
SRAGGGGDAK | | TFKRSYPHAK | | PPYSYISLIT | | MAIQQAPSKM | | LTLSEIYQWI |
MDLFPYYRQN | | QQRWQNSIRH | | SLSFNDCFVK | | VARSPDKPGK | | GSYWTLHPDS |
GNMFENGCYL | | RRQKRFKCEK | | QPGAGGGGGS | | GSGGSGAKGG | | PESRKDPSGA |
SNPSADSPLH | | RGVHGKTGQL | | EGAPAPGPAA | | SPQTLDHSGA | | TATGGASELK |
TPASSTAPPI | | SSGPGALASV | | PASHPAHGLA | | PHESQLHLKG | | DPHYSFNHPF |
SINNLMSSSE | | QQHKLDFKAY | | EQALQYSPYG | | STLPASLPLG | | SASVTTRSPI |
EPSALEPAYY | | QGVYSRPVLN | | TS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|