Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXA3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HOXA3, HOX1, HOX1E, homeobox A3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 142954 MGI: 96175 HomoloGene: 40725 GeneCards: HOXA3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • glossopharyngeal nerve morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • thymus development • transcription, DNA-templated • embryonic skeletal system development • multicellular organism development • animal organ formation • blood vessel remodeling • thyroid gland development • cartilage development • parathyroid gland development • Ангіогенез • positive regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • specification of animal organ position • anterior/posterior pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • calcium ion transport • експресія генів • magnesium ion homeostasis • bone mineralization • negative regulation of calcium ion transport • phosphate ion homeostasis • calcium ion homeostasis • positive regulation of receptor binding • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c3/PBB_GE_HOXA3_208604_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOXA3_208604_s_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 7: 27.11 – 27.15 Mb
| Хр. 6: 52.15 – 52.19 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXA3 (англ. Homeobox A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 46 369[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQKATYYDSS | | AIYGGYPYQA | | ANGFAYNANQ | | QPYPASAALG | | ADGEYHRPAC |
SLQSPSSAGG | | HPKAHELSEA | | CLRTLSAPPS | | QPPSLGEPPL | | HPPPPQAAPP |
APQPPQPAPQ | | PPAPTPAAPP | | PPSSASPPQN | | ASNNPTPANA | | AKSPLLNSPT |
VAKQIFPWMK | | ESRQNTKQKT | | SSSSSGESCA | | GDKSPPGQAS | | SKRARTAYTS |
AQLVELEKEF | | HFNRYLCRPR | | RVEMANLLNL | | TERQIKIWFQ | | NRRMKYKKDQ |
KGKGMLTSSG | | GQSPSRSPVP | | PGAGGYLNSM | | HSLVNSVPYE | | PQSPPPFSKP |
PQGTYGLPPA | | SYPASLPSCA | | PPPPPQKRYT | | AAGAGAGGTP | | DYDPHAHGLQ |
GNGSYGTPHI | | QGSPVFVGGS | | YVEPMSNSGP | | ALFGLTHLPH | | AASGAMDYGG |
AGPLGSGHHH | | GPGPGEPHPT | | YTDLTGHHPS | | QGRIQEAPKL | | THL |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|