Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
IRF8
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| IRF8, H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatory factor 8 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 601565 MGI: 96395 HomoloGene: 1629 GeneCards: IRF8
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хронічний лімфолейкоз, Інфекція, яку спричинює вірус Епштейна — Барр[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to bacterium • positive regulation of interleukin-12 production • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • defense response to bacterium • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • Фагоцитоз • cellular response to lipopolysaccharide • defense response to protozoan • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to interferon-gamma • автофагія • процес імунної системи
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 16: 85.9 – 85.92 Mb
| Хр. 8: 121.46 – 121.48 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
IRF8 (англ. Interferon regulatory factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 48 356[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCDRNGGRRL | | RQWLIEQIDS | | SMYPGLIWEN | | EEKSMFRIPW | | KHAGKQDYNQ |
EVDASIFKAW | | AVFKGKFKEG | | DKAEPATWKT | | RLRCALNKSP | | DFEEVTDRSQ |
LDISEPYKVY | | RIVPEEEQKC | | KLGVATAGCV | | NEVTEMECGR | | SEIDELIKEP |
SVDDYMGMIK | | RSPSPPEACR | | SQLLPDWWAQ | | QPSTGVPLVT | | GYTTYDAHHS |
AFSQMVISFY | | YGGKLVGQAT | | TTCPEGCRLS | | LSQPGLPGTK | | LYGPEGLELV |
RFPPADAIPS | | ERQRQVTRKL | | FGHLERGVLL | | HSSRQGVFVK | | RLCQGRVFCS |
GNAVVCKGRP | | NKLERDEVVQ | | VFDTSQFFRE | | LQQFYNSQGR | | LPDGRVVLCF |
GEEFPDMAPL | | RSKLILVQIE | | QLYVRQLAEE | | AGKSCGAGSV | | MQAPEEPPPD |
QVFRMFPDIC | | ASHQRSFFRE | | NQQITV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|