Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
EMX1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| EMX1, empty spiracles homeobox 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600034 MGI: 95387 HomoloGene: 55799 GeneCards: EMX1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • ядерце
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • homeostasis of number of cells • cerebral cortex regionalization • in utero embryonic development • post-embryonic development • neuron projection extension • neuroepithelial cell differentiation • radial glial cell differentiation • multicellular organism development • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • telencephalon development • brain development • neuron differentiation • cerebral cortex development • cerebral cortex neuron differentiation • brain morphogenesis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 72.92 – 72.94 Mb
| Хр. 6: 85.16 – 85.18 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
EMX1 (англ. Empty spiracles homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 257 амінокислот, а молекулярна маса — 28 039[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFQPAAKRGF | | TIESLVAKDG | | GTGGGTGGGG | | AGSHLLAAAA | | SEEPLRPTAL |
NYPHPSAAEA | | AFVSGFPAAA | | AAGAGRSLYG | | GPELVFPEAM | | NHPALTVHPA |
HQLGASPLQP | | PHSFFGAQHR | | DPLHFYPWVL | | RNRFFGHRFQ | | ASDVPQDGLL |
LHGPFARKPK | | RIRTAFSPSQ | | LLRLERAFEK | | NHYVVGAERK | | QLAGSLSLSE |
TQVKVWFQNR | | RTKYKRQKLE | | EEGPESEQKK | | KGSHHINRWR | | IATKQANGED |
IDVTSND |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|