Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NEUROD2
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NEUROD2, NDRF, bHLHa1, neuronal differentiation 2, EIEE72, DEE72 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 601725 MGI: 107755 HomoloGene: 4489 GeneCards: NEUROD2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• cellular response to calcium ion • regulation of neuron differentiation • диференціація клітин • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • positive regulation of calcium-mediated signaling • associative learning • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • neuron development • transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of synaptic plasticity • negative regulation of synapse maturation • multicellular organism development • positive regulation of synapse maturation • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of neuron differentiation • cerebellar cortex development • regulation of synapse maturation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to electrical stimulus
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 17: 39.6 – 39.61 Mb
| Хр. 11: 98.22 – 98.22 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
NEUROD2 (англ. Neuronal differentiation 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 41 361[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLTRLFSEPG | | LLSDVPKFAS | | WGDGEDDEPR | | SDKGDAPPPP | | PPAPGPGAPG |
PARAAKPVPL | | RGEEGTEATL | | AEVKEEGELG | | GEEEEEEEEE | | EGLDEAEGER |
PKKRGPKKRK | | MTKARLERSK | | LRRQKANARE | | RNRMHDLNAA | | LDNLRKVVPC |
YSKTQKLSKI | | ETLRLAKNYI | | WALSEILRSG | | KRPDLVSYVQ | | TLCKGLSQPT |
TNLVAGCLQL | | NSRNFLTEQG | | ADGAGRFHGS | | GGPFAMHPYP | | YPCSRLAGAQ |
CQAAGGLGGG | | AAHALRTHGY | | CAAYETLYAA | | AGGGGASPDY | | NSSEYEGPLS |
PPLCLNGNFS | | LKQDSSPDHE | | KSYHYSMHYS | | ALPGSRPTGH | | GLVFGSSAVR |
GGVHSENLLS | | YDMHLHHDRG | | PMYEELNAFF | | HN |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація к��ітин, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|