Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SMAD7
|
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2c/SMURF2_SMAD7_complex.png/250px-SMURF2_SMAD7_complex.png) |
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| SMAD7, CRCS3, MADH7, MADH8, SMAD family member 7 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602932 MGI: 1100518 HomoloGene: 4314 GeneCards: SMAD7
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
колоректальний рак[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • beta-catenin binding • type I transforming growth factor beta receptor binding • collagen binding • I-SMAD binding • activin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • центросома • transcription regulator complex • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • catenin complex • клітинне ядро • fibrillar center • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
|
---|
Біологічний процес |
• cellular response to transforming growth factor beta stimulus • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization • pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • adherens junction assembly • positive regulation of cell-cell adhesion • ventricular septum morphogenesis • regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • response to laminar fluid shear stress • protein stabilization • regulation of activin receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • BMP signaling pathway • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • negative regulation of BMP signaling pathway • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • negative regulation of protein ubiquitination • negative regulation of cell migration • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity • artery morphogenesis • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation • regulation of cardiac muscle contraction • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • protein deubiquitination • negative regulation of T cell cytokine production • negative regulation of T-helper 17 type immune response • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • cellular response to leukemia inhibitory factor
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](http://178.128.105.246/host-http-upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/83/PBB_GE_SMAD7_204790_at_fs.png/250px-PBB_GE_SMAD7_204790_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 18: 48.92 – 48.95 Mb
| Хр. 18: 75.5 – 75.53 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
SMAD7 (англ. SMAD family member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 426[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFRTKRSALV | | RRLWRSRAPG | | GEDEEEGAGG | | GGGGGELRGE | | GATDSRAHGA |
GGGGPGRAGC | | CLGKAVRGAK | | GHHHPHPPAA | | GAGAAGGAEA | | DLKALTHSVL |
KKLKERQLEL | | LLQAVESRGG | | TRTACLLLPG | | RLDCRLGPGA | | PAGAQPAQPP |
SSYSLPLLLC | | KVFRWPDLRH | | SSEVKRLCCC | | ESYGKINPEL | | VCCNPHHLSR |
LCELESPPPP | | YSRYPMDFLK | | PTADCPDAVP | | SSAETGGTNY | | LAPGGLSDSQ |
LLLEPGDRSH | | WCVVAYWEEK | | TRVGRLYCVQ | | EPSLDIFYDL | | PQGNGFCLGQ |
LNSDNKSQLV | | QKVRSKIGCG | | IQLTREVDGV | | WVYNRSSYPI | | FIKSATLDNP |
DSRTLLVHKV | | FPGFSIKAFD | | YEKAYSLQRP | | NDHEFMQQPW | | TGFTVQISFV |
KGWGQCYTRQ | | FISSCPCWLE | | VIFNSR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|